More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2724 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2724  major facilitator transporter  100 
 
 
434 aa  853    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  35.53 
 
 
446 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  31.84 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  35.8 
 
 
461 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  33.11 
 
 
482 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  34.33 
 
 
439 aa  213  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  33.87 
 
 
457 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  30.43 
 
 
436 aa  212  9e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  33.87 
 
 
457 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  33.64 
 
 
433 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  33.87 
 
 
457 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  34.35 
 
 
438 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.08 
 
 
438 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  32.92 
 
 
443 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  38.27 
 
 
430 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  31.52 
 
 
444 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 
431 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  30.77 
 
 
447 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  33.26 
 
 
455 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  34.55 
 
 
460 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  36.83 
 
 
430 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  31.45 
 
 
444 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 
440 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  36.04 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  33.33 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
452 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  31.95 
 
 
463 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  30.93 
 
 
465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  34.56 
 
 
429 aa  200  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  33.17 
 
 
433 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  31.38 
 
 
456 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  32.47 
 
 
445 aa  199  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.77 
 
 
437 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  33.33 
 
 
439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  30.48 
 
 
465 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  34.07 
 
 
450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  33.57 
 
 
439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  32.73 
 
 
460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  31.22 
 
 
445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  30.91 
 
 
447 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  32.22 
 
 
460 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  30.84 
 
 
461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  30.84 
 
 
461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  30.84 
 
 
461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  30 
 
 
460 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  31.65 
 
 
459 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 
456 aa  196  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  32.47 
 
 
445 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  31.51 
 
 
464 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 
454 aa  196  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  32.47 
 
 
445 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  33.17 
 
 
439 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  32.48 
 
 
439 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  32.42 
 
 
435 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  32.42 
 
 
435 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  32.42 
 
 
435 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  30.97 
 
 
430 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.81 
 
 
452 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  33.02 
 
 
439 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 
426 aa  194  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  31.88 
 
 
445 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  33.59 
 
 
441 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  32.73 
 
 
461 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  32.9 
 
 
439 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 
469 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  31.46 
 
 
458 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  33.33 
 
 
449 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  34.49 
 
 
442 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  31.84 
 
 
450 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  32.65 
 
 
439 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 
437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  32.9 
 
 
439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  32.65 
 
 
439 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  32.65 
 
 
439 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 
458 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  30.87 
 
 
466 aa  190  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  30.21 
 
 
456 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2900  major facilitator transporter  33.09 
 
 
453 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  31.43 
 
 
444 aa  189  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  36.36 
 
 
442 aa  189  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  32.65 
 
 
439 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  32.65 
 
 
439 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
493 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 
454 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  30.36 
 
 
456 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  33.92 
 
 
439 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  33.09 
 
 
435 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  33.09 
 
 
435 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
442 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  30.42 
 
 
437 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  33.08 
 
 
435 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  34.19 
 
 
452 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  30.5 
 
 
468 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
461 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  33.83 
 
 
460 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
461 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  30.25 
 
 
477 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  33.25 
 
 
437 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  29.61 
 
 
459 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>