More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0539 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0539  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 358 aa  739    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1193  extracellular solute-binding protein  46.93 
 
 		 355 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00611018  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2406  extracellular solute-binding protein family 1  41.88 
 
 		 342 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2920  extracellular solute-binding protein family 1  39.82 
 
 		 341 aa  236  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.458081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2404  extracellular solute-binding protein family 1  40.12 
 
 		 342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2005  extracellular solute-binding protein family 1  38.51 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1566  extracellular solute-binding protein family 1  37.07 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1927  extracellular solute-binding protein family 1  35.26 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  hitchhiker  0.000000194914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  33.79 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  31.86 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1184  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 357 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000549625  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1162  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 357 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  36.39 
 
 		 363 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1534  extracellular solute-binding protein family 1  36.73 
 
 		 357 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2117  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.428561  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0979  extracellular solute-binding protein  33.91 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1018  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0310  extracellular solute-binding protein  33.15 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1337  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.18 
 
 		 348 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0644011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1531  polyamine transport protein PotD  32.46 
 
 		 353 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5405  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.948456  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2779  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  35.01 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0345  extracellular solute-binding protein  34.9 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0344  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.574749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17610  polyamine ABC transporter  32.16 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2146  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.86 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543395 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1322  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.86 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0110419 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1299  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.86 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1962  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.86 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0689  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  31.9 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1636  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  34.65 
 
 		 348 aa  182  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3009  extracellular solute-binding protein  34.26 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.274617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03920  polyamine transport protein  34.49 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0391  polyamine transport protein  34.49 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1501  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0819  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  34.17 
 
 		 371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2144  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.25 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1289  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  33.53 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000830378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1501  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.65 
 
 		 348 aa  180  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00187951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2837  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 		 396 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000153831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  33.43 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  33.43 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  33.43 
 
 		 366 aa  179  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01121  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.44 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2524  extracellular solute-binding protein family 1  35.44 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00059946  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1246  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.44 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0326  extracellular solute-binding protein family 1  34.97 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00599972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2480  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.44 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1243  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.44 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0566185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5307  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  35.07 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2202  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.44 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2003  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.44 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.59191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01129  hypothetical protein  35.44 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  33.15 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1131  extracellular solute-binding protein  33.89 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1241  extracellular solute-binding protein  32.12 
 
 		 371 aa  176  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.447743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1859  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.48 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1064  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 		 373 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3928  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 		 367 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1108  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  32.21 
 
 		 357 aa  176  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2225  extracellular solute-binding protein family 1  31.89 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4865  extracellular solute-binding protein  35.07 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 		 366 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1556  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  34.71 
 
 		 367 aa  176  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 349 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 366 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  32.59 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  33.15 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  32.5 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1612  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  34.44 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0973  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 366 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  33.44 
 
 		 366 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0163  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 		 365 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1736  extracellular solute-binding protein  35.91 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000683653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04220  putative binding protein component of ABC transporter  33.43 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1493  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  33.12 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0784207  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1643  extracellular solute-binding protein  33.63 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6065  extracellular solute-binding protein  36.83 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2677  extracellular solute-binding protein  33.82 
 
 		 361 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163621 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2337  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48760  Polyamine transporter periplasmic protein PotF  33.14 
 
 		 371 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7683  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  34 
 
 		 373 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.370067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0132  extracellular solute-binding protein  33.24 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.911312  normal  0.781797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1367  transcription factor jumonji, jmjC  34.49 
 
 		 365 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2984  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.746343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  33.6 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5181  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  32.95 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7525  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  33.9 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5088  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.781791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5241  extracellular solute-binding protein  33.52 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2135  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5341  ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein, putative  32.96 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.169562  hitchhiker  0.0000795436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5250  extracellular solute-binding protein  32.96 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  33.89 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0344  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1408  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.121808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3516  putrescine ABC transporter, periplasmic binding protein  30.6 
 
 		 368 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0677178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>