143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3660 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  26.55 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  25.38 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  27.47 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  25.26 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  25.56 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  27.04 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  26.14 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  22.63 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  26.74 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  22.97 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  27.07 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  25.18 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  24.46 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  24.91 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  24.82 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  24.46 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  24.46 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  23.91 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  21.94 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  24.9 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  25.45 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  24.39 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  45.9 
 
 		 448 aa  62.4  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  28.45 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  24.82 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  21.77 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  27.59 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  23.23 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  25.08 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  27.59 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  48 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  24.3 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  39.06 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  21.81 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  24.91 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  27.47 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  41.07 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  21.4 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  30.77 
 
 		 566 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  48.28 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  33.66 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  40 
 
 		 511 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  48.28 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  23.47 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  37.93 
 
 		 347 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  27.33 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  42.37 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  46.94 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  37.93 
 
 		 348 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  31.03 
 
 		 357 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  41.38 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  24.47 
 
 		 277 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  27.74 
 
 		 333 aa  52.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  45.28 
 
 		 314 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 345 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3162  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 450 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  23.74 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  36.07 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  27.66 
 
 		 368 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  25.56 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  34.92 
 
 		 404 aa  50.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  35.59 
 
 		 441 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2890  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 457 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0671992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  24.56 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  22.83 
 
 		 210 aa  49.7  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  22.83 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  42.62 
 
 		 273 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  42.62 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  21.35 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  21.35 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  49.3  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 352 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  40.35 
 
 		 245 aa  49.3  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  23.6 
 
 		 295 aa  48.9  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  27.97 
 
 		 368 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  39.29 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  20.88 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  44 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  34.48 
 
 		 372 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  44 
 
 		 360 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 339 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>