More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3579 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 496 aa  953    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  81.93 
 
 		 491 aa  716    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  46.44 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  39.41 
 
 		 483 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  38.59 
 
 		 516 aa  296  8e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  40.87 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  36.91 
 
 		 467 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  38.99 
 
 		 509 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  38.64 
 
 		 484 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  36.71 
 
 		 479 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  36.71 
 
 		 479 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  38.12 
 
 		 464 aa  273  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  40.41 
 
 		 497 aa  270  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  38.75 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  33.78 
 
 		 510 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  33.78 
 
 		 510 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  33.78 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  40.17 
 
 		 488 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  41.87 
 
 		 498 aa  254  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  39.48 
 
 		 484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  35.9 
 
 		 485 aa  253  6e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  33.53 
 
 		 516 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  41.59 
 
 		 486 aa  249  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  32.89 
 
 		 510 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  37.61 
 
 		 510 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  32.31 
 
 		 513 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  37.58 
 
 		 509 aa  242  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  40.19 
 
 		 497 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  33.49 
 
 		 490 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  35.81 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  33.94 
 
 		 481 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  31.91 
 
 		 504 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  32.1 
 
 		 493 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 486 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  30.97 
 
 		 474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 487 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  35.84 
 
 		 483 aa  193  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  31.64 
 
 		 485 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  29.62 
 
 		 527 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  34.54 
 
 		 504 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  31.76 
 
 		 502 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  34.09 
 
 		 507 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 449 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  27.01 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  26.49 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 461 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  26.76 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  25.7 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  22.54 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  26.17 
 
 		 413 aa  67  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3002  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.993611  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  24.25 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  23.55 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  23.59 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 455 aa  63.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1698  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.471872  normal  0.470522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  23.23 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  23.23 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02211  amino acid transporter  28.75 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  24.93 
 
 		 461 aa  62  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1860  putative transporter  26.21 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.58 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  23.44 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2299  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  27.36 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  27.36 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 507 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 516 aa  60.1  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  27.94 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  22.87 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  22.87 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  22.87 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  22.87 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  22.87 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  22.87 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  30.57 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  25.27 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  27.42 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3893  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.375275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  22.87 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  30.09 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 468 aa  57  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3032  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 485 aa  56.6  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 		 521 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2563  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.239027  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  22.19 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2616  amino acid permease-associated region  24.45 
 
 		 464 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923502  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 511 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  24.83 
 
 		 506 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>