More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0857 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0857  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 
703 aa  1445    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0733  glycogen debranching enzyme GlgX  75.53 
 
 
704 aa  1116    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1306  glycogen debranching enzyme GlgX  48.22 
 
 
720 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.348446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1726  glycogen debranching enzyme GlgX  43.59 
 
 
748 aa  549  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10400  glycogen debranching enzyme GlgX  54.68 
 
 
822 aa  527  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2413  glycogen debranching enzyme GlgX  47.56 
 
 
771 aa  527  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246896  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  46.18 
 
 
691 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  46.09 
 
 
701 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  47.2 
 
 
730 aa  519  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  42.29 
 
 
727 aa  512  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  42.56 
 
 
715 aa  515  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  43.96 
 
 
720 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  43.26 
 
 
712 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19030  glycogen debranching enzyme GlgX  46.27 
 
 
747 aa  515  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1345  glycogen debranching enzyme GlgX  48.8 
 
 
756 aa  515  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412399  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  46.15 
 
 
704 aa  510  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  43.18 
 
 
727 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  44.35 
 
 
707 aa  510  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  43.35 
 
 
719 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  45.96 
 
 
711 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  45.15 
 
 
721 aa  511  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  43.57 
 
 
713 aa  511  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  44.72 
 
 
714 aa  511  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  42.58 
 
 
727 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  45.87 
 
 
708 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  43.08 
 
 
710 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  41.8 
 
 
721 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  42.94 
 
 
729 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  46.23 
 
 
706 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  46.34 
 
 
700 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  44.25 
 
 
718 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  42.88 
 
 
717 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  42.88 
 
 
717 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  44.85 
 
 
755 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  43.69 
 
 
717 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  44.59 
 
 
701 aa  504  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  45.45 
 
 
722 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  44.46 
 
 
708 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  42.84 
 
 
706 aa  503  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  45.45 
 
 
720 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  43.01 
 
 
711 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  45.45 
 
 
720 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  44.88 
 
 
715 aa  505  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  43.17 
 
 
711 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  42.96 
 
 
711 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  42.46 
 
 
758 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  42.46 
 
 
758 aa  501  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0537  glycogen debranching enzyme GlgX  42.57 
 
 
695 aa  502  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  43.63 
 
 
709 aa  499  1e-140  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  45.87 
 
 
720 aa  501  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  42.56 
 
 
704 aa  502  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  42.3 
 
 
717 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  49.29 
 
 
703 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  43.75 
 
 
717 aa  499  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  42.51 
 
 
738 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  42.64 
 
 
716 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  45.41 
 
 
709 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  49.91 
 
 
709 aa  496  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  43.6 
 
 
712 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1101  glycogen debranching enzyme GlgX  45.05 
 
 
738 aa  498  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429589  hitchhiker  0.00127607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  44.1 
 
 
712 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  44.18 
 
 
733 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  41.62 
 
 
738 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  42.64 
 
 
716 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  41.34 
 
 
710 aa  498  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  41.98 
 
 
707 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  43.85 
 
 
754 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  44.5 
 
 
706 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  40.53 
 
 
726 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  43.74 
 
 
712 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  43.8 
 
 
712 aa  495  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  47.64 
 
 
779 aa  494  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  45.69 
 
 
727 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2978  glycogen debranching enzyme GlgX  45.81 
 
 
850 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  44.5 
 
 
719 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  43.74 
 
 
802 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  44.68 
 
 
673 aa  494  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  48.08 
 
 
701 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  43.85 
 
 
751 aa  495  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  46.5 
 
 
718 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  44.36 
 
 
708 aa  491  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  45.8 
 
 
718 aa  492  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  43.53 
 
 
714 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  43.05 
 
 
708 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  41.79 
 
 
720 aa  491  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  43.53 
 
 
714 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  43.89 
 
 
701 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  43.53 
 
 
714 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  42.67 
 
 
756 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  42.25 
 
 
723 aa  492  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  44.39 
 
 
723 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  42.23 
 
 
739 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  40.83 
 
 
721 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  47.91 
 
 
720 aa  487  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  45.13 
 
 
779 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  43.55 
 
 
722 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  43.91 
 
 
728 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  41.69 
 
 
755 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  41.83 
 
 
757 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  43.01 
 
 
1464 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>