More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0577 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  90.87 
 
 
459 aa  810    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  68.91 
 
 
484 aa  639    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  100 
 
 
460 aa  922    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  66.67 
 
 
461 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  66.67 
 
 
461 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  66.67 
 
 
461 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  64.19 
 
 
450 aa  584  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  65.17 
 
 
456 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  65.53 
 
 
447 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  62.65 
 
 
443 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  54.44 
 
 
459 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  54.04 
 
 
458 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  52.64 
 
 
459 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  52.42 
 
 
459 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  55.86 
 
 
457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  50.68 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  49.07 
 
 
439 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  48.6 
 
 
437 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  49.09 
 
 
438 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  44.37 
 
 
455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  46.47 
 
 
460 aa  353  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  43.81 
 
 
435 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  43.81 
 
 
435 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  43.81 
 
 
435 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  44.31 
 
 
439 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  44.08 
 
 
439 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  43.84 
 
 
439 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  43.15 
 
 
438 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.39 
 
 
438 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  43.36 
 
 
439 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  43.13 
 
 
441 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  43.67 
 
 
461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  41.5 
 
 
460 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  41.5 
 
 
460 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  41.99 
 
 
445 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  42.46 
 
 
445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  42.46 
 
 
445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  42.23 
 
 
445 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  41.7 
 
 
445 aa  306  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  39.63 
 
 
429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.92 
 
 
450 aa  303  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  39.11 
 
 
468 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  39.23 
 
 
442 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 
435 aa  300  5e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  41.57 
 
 
433 aa  299  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.18 
 
 
452 aa  295  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 
448 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  43.54 
 
 
452 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  40.23 
 
 
461 aa  293  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  37.36 
 
 
439 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3519  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 
444 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 
431 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  41.59 
 
 
456 aa  289  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 
452 aa  289  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  39.19 
 
 
439 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  42.3 
 
 
455 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 
466 aa  288  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  39.36 
 
 
482 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0176  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 
449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  41.71 
 
 
430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  39.21 
 
 
444 aa  286  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  41.37 
 
 
454 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 
456 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.17 
 
 
437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  39.16 
 
 
439 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1110  major facilitator superfamily protein  38.26 
 
 
449 aa  282  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0094  major facilitator transporter  41.04 
 
 
443 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  41.72 
 
 
451 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  37.16 
 
 
465 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.61 
 
 
437 aa  280  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  41.34 
 
 
442 aa  279  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  37.56 
 
 
463 aa  279  8e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  39.68 
 
 
442 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  38.44 
 
 
443 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  36.83 
 
 
444 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 
444 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 
474 aa  277  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  38.11 
 
 
435 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  38.11 
 
 
435 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  38.39 
 
 
465 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  38.24 
 
 
446 aa  276  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  39.36 
 
 
446 aa  276  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  39.58 
 
 
433 aa  276  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  37.89 
 
 
465 aa  276  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  37.44 
 
 
444 aa  276  8e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  40.92 
 
 
457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  39.34 
 
 
445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  40.32 
 
 
452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  38.24 
 
 
439 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3577  major facilitator transporter  39.72 
 
 
453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3540  major facilitator transporter  40.27 
 
 
463 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  37.78 
 
 
437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 
442 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  37.56 
 
 
439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  37.97 
 
 
447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  38.1 
 
 
434 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  37.56 
 
 
435 aa  273  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  42.2 
 
 
449 aa  273  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
449 aa  272  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  37.53 
 
 
430 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>