More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0341 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 308 aa  611  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  80 
 
 		 347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  59.35 
 
 		 313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  57.76 
 
 		 296 aa  325  7e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  60.46 
 
 		 307 aa  321  9.000000000000001e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  57.74 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  58.17 
 
 		 287 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  56.62 
 
 		 291 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  54.97 
 
 		 291 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  63.1 
 
 		 288 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  55.93 
 
 		 303 aa  296  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  58.53 
 
 		 311 aa  296  4e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  55.33 
 
 		 310 aa  292  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  56.91 
 
 		 303 aa  285  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  52.3 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  53.49 
 
 		 299 aa  279  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  53.64 
 
 		 285 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  52.32 
 
 		 329 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  54.55 
 
 		 315 aa  276  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  53.44 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  55.23 
 
 		 581 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  50.48 
 
 		 293 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  52.08 
 
 		 313 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  50 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  47.57 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  54.36 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  50.34 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  50.87 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  50.99 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  47.32 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  46.86 
 
 		 304 aa  239  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  46.51 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  46.51 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  46.51 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  41 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  47.73 
 
 		 335 aa  228  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  48.66 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  44.31 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  40.37 
 
 		 318 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  37.89 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  36.84 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  40.79 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  40 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  36.25 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  41.06 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  40.96 
 
 		 383 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  38.85 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  35.98 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  39.81 
 
 		 363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2122  HhH-GPD family protein  39.84 
 
 		 319 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  41.51 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  36.84 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  37.92 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  39.32 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.46 
 
 		 368 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.92 
 
 		 375 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  40.09 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  38.78 
 
 		 370 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.19 
 
 		 360 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  38.56 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.33 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  37.67 
 
 		 352 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  35.84 
 
 		 381 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  38.31 
 
 		 368 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  38.94 
 
 		 360 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  38.31 
 
 		 368 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  38.31 
 
 		 368 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.81 
 
 		 372 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  38.24 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.15 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  35.04 
 
 		 419 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  36.36 
 
 		 365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  35.8 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  43.04 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  44.6 
 
 		 615 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.91 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  39.25 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  40.38 
 
 		 357 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  39.6 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.37 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  36.92 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1001  HhH-GPD family protein  41.28 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  36.09 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  35.04 
 
 		 372 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  35.04 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.12 
 
 		 344 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1792  A/G-specific adenine glycosylase  36.52 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0591785  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.09 
 
 		 345 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1607  A/G-specific adenine glycosylase  36.52 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40 
 
 		 357 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  36.82 
 
 		 354 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  36.67 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1974  A/G-specific adenine glycosylase  36.52 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  37.32 
 
 		 362 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  38.84 
 
 		 368 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  41.55 
 
 		 367 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  37.32 
 
 		 363 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>