More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1605 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 431 aa  833    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.5 
 
 		 425 aa  269  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.9 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0220832  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7255  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.24 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3362  histidine kinase  41.97 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00821775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  40.05 
 
 		 426 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4874  histidine kinase  41.96 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3827  ATPase domain-containing protein  43.27 
 
 		 425 aa  226  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00884096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4020  histidine kinase  37.44 
 
 		 444 aa  222  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2455  histidine kinase  41.69 
 
 		 441 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.868228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4857  histidine kinase  41.38 
 
 		 441 aa  212  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  51.87 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1767  histidine kinase  40.8 
 
 		 469 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422503  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1780  cell wall anchor domain-containing protein  42.16 
 
 		 360 aa  162  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  35.36 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  30.57 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  30.16 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  30.13 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  33.08 
 
 		 448 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  34.83 
 
 		 427 aa  99.8  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 483 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  30.07 
 
 		 463 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 478 aa  96.7  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  30.67 
 
 		 594 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3903  histidine kinase  30.69 
 
 		 483 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.39604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  30.03 
 
 		 482 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  31.15 
 
 		 536 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  31.02 
 
 		 461 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  35.57 
 
 		 425 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  33.45 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 453 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  33.7 
 
 		 478 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  29.77 
 
 		 608 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  32.09 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 483 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 527 aa  90.9  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 454 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  33.33 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  35.19 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.69 
 
 		 512 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  28.46 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.64 
 
 		 461 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 465 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 504 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 536 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 471 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 454 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.68 
 
 		 467 aa  88.2  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 579 aa  87.8  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  32.06 
 
 		 439 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 454 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  29.72 
 
 		 359 aa  87.4  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 452 aa  87  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0558  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.33 
 
 		 431 aa  87  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  30.51 
 
 		 467 aa  87  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  26.15 
 
 		 432 aa  86.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  32.08 
 
 		 445 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  35.83 
 
 		 472 aa  86.7  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.28 
 
 		 461 aa  86.7  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 454 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.28 
 
 		 461 aa  86.7  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  22.67 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  31.36 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.26 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 485 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2599  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  30.74 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  30.21 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  25.09 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21080  signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  32.26 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.15 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 546 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  31.43 
 
 		 586 aa  84.7  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  34.89 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3147  sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0895878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08520  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0435265  normal  0.631438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 605 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  32.33 
 
 		 538 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.55 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.21 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.55 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.55 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.55 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>