More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1537 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2242  glycine hydroxymethyltransferase  77.64 
 
 		 420 aa  664    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0554627 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1537  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 427 aa  866    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.54072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6691  Glycine hydroxymethyltransferase  76.37 
 
 		 418 aa  665    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476522  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2509  serine hydroxymethyltransferase  72.18 
 
 		 420 aa  632  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0231  Glycine hydroxymethyltransferase  71.23 
 
 		 423 aa  624  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.681161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1644  serine hydroxymethyltransferase  71.5 
 
 		 420 aa  609  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0624  serine hydroxymethyltransferase  71.12 
 
 		 420 aa  610  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.260999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 417 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  54.83 
 
 		 412 aa  480  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  56.87 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 427 aa  477  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 432 aa  472  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  56.87 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 		 411 aa  474  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  56.63 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 420 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  54.11 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  56.28 
 
 		 414 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  55.31 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  53.86 
 
 		 412 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  56.93 
 
 		 412 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  55.31 
 
 		 415 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  54.83 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 419 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  56.52 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  56.46 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  55.45 
 
 		 433 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  56.46 
 
 		 438 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  53.62 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  53.1 
 
 		 425 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  55.31 
 
 		 440 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  54.05 
 
 		 415 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  53.1 
 
 		 425 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  52.62 
 
 		 418 aa  458  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  56.7 
 
 		 438 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 411 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  54.92 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  53.85 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  54.72 
 
 		 431 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  53.28 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  53.62 
 
 		 415 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  54.96 
 
 		 431 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  55.39 
 
 		 413 aa  455  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 437 aa  455  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  53.85 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 		 413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  56.07 
 
 		 436 aa  451  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  54.72 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  54.24 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  56.57 
 
 		 412 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  53.88 
 
 		 421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  57.93 
 
 		 418 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0436  serine hydroxymethyltransferase  52.14 
 
 		 415 aa  448  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_378  serine hydroxymethyltransferase  52.38 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0413  serine hydroxymethyltransferase  52.14 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.774669  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  54.35 
 
 		 434 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  53.38 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  55.64 
 
 		 434 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000232  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  56.04 
 
 		 434 aa  448  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05971  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  53.53 
 
 		 412 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 434 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 434 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  55.93 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  55.64 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  56.04 
 
 		 432 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  55.24 
 
 		 414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  53.28 
 
 		 410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  55.1 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  55.4 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 412 aa  441  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  53.38 
 
 		 424 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  55.28 
 
 		 414 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  54.35 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0952  serine hydroxymethyltransferase  56.07 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  53.01 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  52.93 
 
 		 414 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  52.9 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  51.69 
 
 		 413 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  53.16 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  53.81 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  52.93 
 
 		 414 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  54 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  54.11 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  52 
 
 		 415 aa  440  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  49.64 
 
 		 423 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3717  serine hydroxymethyltransferase  58.36 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.848378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>