More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1390 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  440  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1549  two component transcriptional regulator, LuxR family  71.63 
 
 		 238 aa  302  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196807  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1583  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.22 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00238178  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6781  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3546  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.98 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000843196  hitchhiker  0.00749158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.55 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.02 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.35 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.35 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.61 
 
 		 214 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3314  putative two-component response regulator  36.71 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.1 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  37.14 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  38.07 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38900  putative two-component response regulator  37.5 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.899747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  38.05 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.63 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  37.02 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00996  response regulator  36.18 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06170  response regulator  36.18 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.624626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 209 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  37.09 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  33.5 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.13 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  33.5 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0991  two component LuxR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.42 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.63 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.19 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2786  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0443035  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  30.93 
 
 		 219 aa  105  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.12 
 
 		 220 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  37.9 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 210 aa  105  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.25 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 216 aa  104  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0851  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.15 
 
 		 232 aa  104  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2295  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 222 aa  104  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.06 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.91 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.8 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4250  two component LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>