More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0571 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0571  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
287 aa  565  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.044824  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
260 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
256 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00394845  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609923  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 
244 aa  96.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
281 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223454  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
273 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19021  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 
250 aa  92.8  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 
244 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  27.07 
 
 
261 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  27.44 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  26.69 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  26.69 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
244 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  26.69 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  29.81 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.848972 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.99 
 
 
248 aa  90.5  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  27.07 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  32.7 
 
 
252 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
248 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0136754  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  27.07 
 
 
261 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
249 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  27.44 
 
 
261 aa  89  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  27.07 
 
 
261 aa  89  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0453  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  25.86 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  31.5 
 
 
248 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
249 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  32.34 
 
 
254 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  27.07 
 
 
261 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
261 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0435  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.13 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.137022  normal  0.193907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05091  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  25.86 
 
 
249 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
252 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.1 
 
 
272 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
250 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.07 
 
 
272 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
244 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.09 
 
 
252 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
275 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.591331  normal  0.119727 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  26.39 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  26.39 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04781  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  26.24 
 
 
249 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
254 aa  86.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425319  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.38 
 
 
252 aa  86.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  26.19 
 
 
247 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.38 
 
 
252 aa  86.3  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
244 aa  85.9  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.806753 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  26.19 
 
 
247 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3492  short chain dehydrogenase  32.83 
 
 
256 aa  85.9  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.65 
 
 
250 aa  85.5  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.63 
 
 
261 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0368  glucose-1-dehydrogenase  26.49 
 
 
261 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0342914  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  28.79 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.28 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.26 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2523  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  27.2 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.23 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.59 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000225653  hitchhiker  0.0000000041248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.52 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219217  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2964  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  27.2 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  hitchhiker  0.0000180421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  30.39 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.59 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05161  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  24.43 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.426884  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 
251 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.57 
 
 
256 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.41 
 
 
261 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.372057  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 
255 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.36 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.56 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  27.78 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  27.78 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>