More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0318 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  81.01 
 
 		 189 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  80.56 
 
 		 189 aa  310  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  75.13 
 
 		 191 aa  302  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  77.09 
 
 		 194 aa  301  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  77.22 
 
 		 191 aa  300  7.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  75.27 
 
 		 198 aa  298  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  72.68 
 
 		 192 aa  295  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  69.54 
 
 		 199 aa  292  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  75.28 
 
 		 190 aa  291  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  75.42 
 
 		 191 aa  289  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  75.28 
 
 		 193 aa  289  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  75.84 
 
 		 193 aa  288  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  73.89 
 
 		 189 aa  288  5.0000000000000004e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  75.98 
 
 		 187 aa  286  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  74.72 
 
 		 192 aa  286  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  74.3 
 
 		 191 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  73.18 
 
 		 190 aa  284  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  72.07 
 
 		 187 aa  283  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  72.47 
 
 		 189 aa  281  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  75.66 
 
 		 189 aa  281  6.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  73.89 
 
 		 188 aa  279  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  76.02 
 
 		 184 aa  277  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  75.53 
 
 		 189 aa  272  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  76.65 
 
 		 199 aa  267  8e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  76.67 
 
 		 187 aa  266  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  76.67 
 
 		 187 aa  266  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  76.67 
 
 		 187 aa  266  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  67.04 
 
 		 190 aa  266  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  71.96 
 
 		 189 aa  265  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  71.96 
 
 		 189 aa  264  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  67.6 
 
 		 190 aa  263  8e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  75.56 
 
 		 187 aa  262  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  70.41 
 
 		 192 aa  259  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  74.3 
 
 		 192 aa  256  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  63.33 
 
 		 183 aa  255  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  73.33 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  71.51 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  73.18 
 
 		 189 aa  248  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 191 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  62.43 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 189 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 180 aa  240  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 181 aa  236  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  234  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 178 aa  231  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 182 aa  231  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  60.67 
 
 		 180 aa  231  7.000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  57.46 
 
 		 187 aa  230  8.000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 181 aa  230  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 180 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 182 aa  230  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 180 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  54.17 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 180 aa  229  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  56.28 
 
 		 197 aa  229  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 180 aa  228  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 192 aa  228  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  56.59 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 180 aa  228  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 193 aa  228  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  227  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 184 aa  227  8e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 179 aa  227  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  56.83 
 
 		 243 aa  226  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 178 aa  226  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2220  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 178 aa  227  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  58.33 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  57.06 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  58.79 
 
 		 185 aa  225  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  56.18 
 
 		 181 aa  224  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 180 aa  225  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  225  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>