More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0658 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0658  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0392  helix-turn-helix domain-containing protein  34.64 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1822  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1419  transcriptional regulator, AraC family  40.27 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00505932  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  25 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  33.77 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.45 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  33.65 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  32.11 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  39.18 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  31.68 
 
 		 343 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  31.02 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  29.46 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  38.24 
 
 		 302 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  35.85 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.26 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1284  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.960401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  26.53 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  35.85 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.3 
 
 		 164 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  35.85 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  35.85 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1439  transcriptional regulator, AraC family  39.17 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257773  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2162  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.637504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 668 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  36.04 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  24.2 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  35.92 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  34.29 
 
 		 141 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  33.33 
 
 		 1343 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2517  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.79 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23290  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 145 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0457  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.761894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 234 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  30.63 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.17 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>