More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1252 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 232 aa  455  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0156  gluconate operon transcriptional repressor  33.66 
 
 		 243 aa  118  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0154  gluconate operon transcriptional repressor  33.66 
 
 		 243 aa  118  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0183  gluconate operon transcriptional repressor  33.66 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0205  gluconate operon transcriptional repressor  33.66 
 
 		 243 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0162  gluconate operon transcriptional repressor  33.17 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0161  gluconate operon transcriptional repressor  33.17 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2059  gluconate operon transcriptional repressor  28.1 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2582  gluconate operon transcriptional repressor  28.57 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.623222  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2530  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 267 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 235 aa  88.2  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  34.09 
 
 		 250 aa  85.1  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  34.8 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0843233  normal  0.231576 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  25.48 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.85 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  28.84 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  27.85 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  30.41 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.54 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1568  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  26.77 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.03 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  30.41 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.21 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>