More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1050 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1050  NLP/P60 protein  100 
 
 
180 aa  374  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.816748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2772  hypothetical protein  41.1 
 
 
255 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  38.93 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  35.77 
 
 
232 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  34.19 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  39.22 
 
 
452 aa  74.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  36.51 
 
 
1048 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  39.34 
 
 
341 aa  71.6  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  37.25 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  32.64 
 
 
424 aa  70.9  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  32.28 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  34.46 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  33.73 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  33.73 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  33.13 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  30.41 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  38.21 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  31.88 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  31.88 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  31.88 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  31.88 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  31.88 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  31.88 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  31.88 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  31.88 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  34.46 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  31.88 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  31.5 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  36.18 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  31.88 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  31.88 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  31.88 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  31.88 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  31.88 
 
 
275 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  35.92 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  31.5 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  37.19 
 
 
370 aa  67.8  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  42.42 
 
 
227 aa  67.8  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
335 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  38.1 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  34.62 
 
 
224 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  32.91 
 
 
241 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  40.62 
 
 
391 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  32.91 
 
 
241 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  38.89 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  32.65 
 
 
370 aa  67  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  32.91 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  31.9 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  30.71 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  40.43 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  31.62 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  41.3 
 
 
432 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  41.3 
 
 
432 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.33 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  34.44 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  32.59 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  42.11 
 
 
333 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  35.04 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  38.51 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  33.12 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  34.25 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  31.32 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  35.16 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  35.16 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  32.05 
 
 
388 aa  65.5  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  31.76 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.22 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  39.78 
 
 
350 aa  65.5  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  34.62 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  42.57 
 
 
366 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.76 
 
 
337 aa  64.7  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  38.04 
 
 
242 aa  64.7  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  36.75 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  31.47 
 
 
210 aa  64.3  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  30.94 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  38.02 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  34.74 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  31.74 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  33.08 
 
 
211 aa  64.3  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  33.85 
 
 
234 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  27.65 
 
 
228 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  33.85 
 
 
234 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  36.07 
 
 
246 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  33.85 
 
 
221 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  33.33 
 
 
197 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  41.3 
 
 
256 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  33.33 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  33.53 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  31.93 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  31.25 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  33.85 
 
 
234 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  33.08 
 
 
224 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  31.1 
 
 
223 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  33.08 
 
 
223 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  32.81 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  33.85 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  32.24 
 
 
239 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.68 
 
 
372 aa  63.2  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  33.85 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>