189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_04505 on replicon BN001303
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_04505  RNA binding protein (Rbm8A), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03260)  100 
 
 
158 aa  322  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0453998  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9485  predicted protein  59.3 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0359849  normal  0.11207 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05100  RNA binding protein, putative  43.65 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247745  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20716  predicted protein  46.51 
 
 
138 aa  103  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  35.48 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  35.48 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  35.48 
 
 
98 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  34.02 
 
 
101 aa  60.8  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  35.48 
 
 
98 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  32.58 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  33.7 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  31.63 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  37.33 
 
 
196 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  36 
 
 
250 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  36 
 
 
250 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  40 
 
 
95 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  34 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  37.33 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  32.22 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  35.96 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  37.33 
 
 
245 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2882  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
108 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145545  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0802  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  34.67 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  34.74 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  36 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  38.67 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  32 
 
 
441 aa  55.1  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 
202 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  31.82 
 
 
110 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  32.35 
 
 
99 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  36 
 
 
222 aa  54.3  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  30.34 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  37.33 
 
 
222 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
111 aa  53.9  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  32.22 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  37.33 
 
 
217 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  34.67 
 
 
81 aa  53.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  30.61 
 
 
99 aa  53.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4045  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
196 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.847138 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  34.72 
 
 
81 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  32.22 
 
 
89 aa  52.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
90 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  34.18 
 
 
86 aa  52.4  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  37.33 
 
 
203 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02490  hypothetical protein  34.72 
 
 
287 aa  51.6  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.471511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3960  RNP-1 like RNA-binding protein  36.62 
 
 
195 aa  51.6  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000285938  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  31.43 
 
 
100 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  37.33 
 
 
95 aa  50.8  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  35.37 
 
 
769 aa  50.4  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  40.32 
 
 
107 aa  50.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43898  predicted protein  32.69 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00800465  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  29.85 
 
 
373 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  33.33 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  34.67 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  34.67 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10765  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G (eIF3g)(Translation initiation factor eIF3 p33 subunit homolog)(eIF3 p33 homolog)(Eukaryotic translation initiation factor 3 RNA-binding subunit)(eIF-3 RNA-binding subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0B3]  31.94 
 
 
289 aa  48.9  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0100571 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03870  transformer-2-beta isoform 3, putative  33.33 
 
 
277 aa  48.9  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  35.48 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9858  predicted protein  29.35 
 
 
92 aa  48.9  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0809817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1450  RNP-1 like RNA-binding protein  30.53 
 
 
110 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000575333  unclonable  0.00000561539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  32.95 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 
89 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  29.33 
 
 
103 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  34.67 
 
 
107 aa  48.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1536  RNP-1 like RNA-binding protein  35.48 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  27.71 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  29.41 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  31.17 
 
 
838 aa  47.4  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2631  RNA-binding region RNP-1  35.21 
 
 
134 aa  47.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000024713  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06142  small subunit of nuclear cap-binding protein complex (AFU_orthologue; AFUA_2G08570)  34.57 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.040408  normal  0.207556 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06030  RNA binding protein, putative  27.27 
 
 
393 aa  47  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4324  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000014654  normal  0.0291528 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  36 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4264  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
90 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06681  splicing factor u2af large subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G05310)  36.11 
 
 
547 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.502661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2901  RNP-1 like RNA-binding protein  32.63 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  31.33 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16281  predicted protein  32.91 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  32.89 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48043  predicted protein  24.69 
 
 
233 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111526  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  36.76 
 
 
288 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07706  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08310)  36.76 
 
 
328 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09095  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 4 (PPIase)(Rotamase)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARI5]  26.21 
 
 
461 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.844465 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  30.3 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2498  RNA binding protein  28 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3413  hypothetical protein  29.11 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.212369  normal  0.0411196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  29.41 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>