More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3583 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  98.6 
 
 
500 aa  864    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  100 
 
 
495 aa  952    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  97.37 
 
 
495 aa  841    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  48.68 
 
 
501 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  45.89 
 
 
503 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  47.47 
 
 
476 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  50.9 
 
 
502 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  47.68 
 
 
474 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  47.47 
 
 
474 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  45.96 
 
 
519 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  46.84 
 
 
475 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  49.29 
 
 
499 aa  364  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  48.87 
 
 
493 aa  358  9e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  44.99 
 
 
495 aa  342  7e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  42.57 
 
 
476 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  45.53 
 
 
483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  45.98 
 
 
501 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  47.06 
 
 
472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  44.98 
 
 
499 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  46.71 
 
 
493 aa  332  8e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  45.11 
 
 
489 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  45.11 
 
 
489 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  45.11 
 
 
489 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  46.76 
 
 
489 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  46.98 
 
 
493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  42.94 
 
 
473 aa  325  8.000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  44.54 
 
 
508 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  45.25 
 
 
490 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  48.4 
 
 
492 aa  318  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  46.41 
 
 
496 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  45.03 
 
 
496 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  46.48 
 
 
494 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  46.48 
 
 
494 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  46.48 
 
 
494 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  45.77 
 
 
496 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  43.32 
 
 
482 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  45.69 
 
 
517 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  45.49 
 
 
521 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  44.96 
 
 
509 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  46.49 
 
 
496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  40.82 
 
 
497 aa  304  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  44.25 
 
 
506 aa  302  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  45.4 
 
 
474 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  43 
 
 
481 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  44.35 
 
 
492 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  43.93 
 
 
492 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  43.31 
 
 
522 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  37.95 
 
 
531 aa  294  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  42.71 
 
 
479 aa  292  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  43.65 
 
 
504 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  39.47 
 
 
488 aa  289  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  44.53 
 
 
492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  44.29 
 
 
495 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  42.21 
 
 
492 aa  280  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  45.16 
 
 
492 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  43.97 
 
 
485 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  40.37 
 
 
496 aa  276  7e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  44.56 
 
 
492 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  44.56 
 
 
492 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  40.86 
 
 
491 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  37.9 
 
 
476 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  40.85 
 
 
480 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  39.96 
 
 
474 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  40.85 
 
 
480 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  40.85 
 
 
480 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  40.77 
 
 
489 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  39.71 
 
 
483 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3053  amidase  44.12 
 
 
475 aa  269  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.807445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  42.14 
 
 
476 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0518  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  38.54 
 
 
498 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  40.45 
 
 
484 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  41.25 
 
 
494 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  43.46 
 
 
492 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  39.27 
 
 
476 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  43.7 
 
 
489 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  43.52 
 
 
489 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1602  amidase  41.97 
 
 
476 aa  259  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270176  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  43.7 
 
 
489 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  38.68 
 
 
481 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  41.65 
 
 
476 aa  251  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  37.04 
 
 
502 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  39.08 
 
 
473 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  40.76 
 
 
470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0191  amidase  36.96 
 
 
492 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7330  amidase  39.47 
 
 
477 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2536  amidase  38.1 
 
 
475 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221374  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7187  putative amidase  35.02 
 
 
491 aa  233  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349285  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3416  Amidase  40.82 
 
 
486 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  40.04 
 
 
466 aa  231  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  39.67 
 
 
470 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1519  amidase  35.76 
 
 
488 aa  228  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  35.33 
 
 
460 aa  228  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1346  Amidase  40.52 
 
 
476 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.515427  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  34.05 
 
 
460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  38.06 
 
 
503 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  37.35 
 
 
467 aa  220  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3007  Amidase  42.09 
 
 
495 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  36.1 
 
 
479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1839  Amidase  33.61 
 
 
490 aa  217  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1076  amidase  33.88 
 
 
470 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>