More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1975 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1975  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1890  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1988  50S ribosomal protein L3  98.73 
 
 		 236 aa  470  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.890022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1851  50S ribosomal protein L3  88.98 
 
 		 236 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722115 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  46.82 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  48.18 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  42.4 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  46.3 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 		 210 aa  185  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  45.7 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  45.54 
 
 		 207 aa  182  5.0000000000000004e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  43.32 
 
 		 210 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  46.38 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  45.87 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  42.01 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  45.62 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  42.53 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0477  ribosomal protein L3  43.86 
 
 		 245 aa  178  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  47.91 
 
 		 214 aa  178  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  44.08 
 
 		 207 aa  178  7e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  44.08 
 
 		 207 aa  178  7e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0291  50S ribosomal protein L3  42.33 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0279726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  43.12 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  43.12 
 
 		 209 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  45.58 
 
 		 206 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  44.7 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  44.95 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  44.95 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  47.69 
 
 		 213 aa  175  6e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  44.95 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  42.47 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  44.65 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  43.19 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1226  50S ribosomal protein L3  42.48 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0600156  unclonable  0.00000985108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  42.99 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  44.95 
 
 		 210 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  43.64 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0158  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206645  decreased coverage  0.0000470561 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  44.91 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  42.79 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  41.28 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 		 211 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 		 211 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 		 211 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  41.1 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4690  50S ribosomal protein L3  44.95 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000266431  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  41.63 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  43.06 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3019  50S ribosomal protein L3  43.24 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000216849  hitchhiker  0.0059333 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  45.71 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  43.48 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  45.21 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  42.4 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  42.72 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  43.54 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  41.1 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  41.94 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 		 212 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3759  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000358076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  43.72 
 
 		 216 aa  168  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  41.47 
 
 		 214 aa  168  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4317  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 212 aa  168  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000715109  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3447  50S ribosomal protein L3  43.32 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000108395  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  43.58 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0196  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133275  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  43.38 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4170  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200962  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  43.26 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4056  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000139517  hitchhiker  0.00000000018898 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0200  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000546138  unclonable  0.00000936811 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  41.01 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  43.33 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  44.86 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  43.26 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  42.86 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  43.72 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2632  50S ribosomal protein L3  43.32 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.000000000488611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3746  50S ribosomal protein L3  43.32 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000021686  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2840  50S ribosomal protein L3  42.86 
 
 		 219 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3776  50S ribosomal protein L3  43.32 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000325408  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3478  50S ribosomal protein L3  43.32 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.00000000879138  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3068  50S ribosomal protein L3  43.32 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000718216  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  42.79 
 
 		 212 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1924  50S ribosomal protein L3  43.32 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000132844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  44.65 
 
 		 209 aa  166  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3804  50S ribosomal protein L3  43.32 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000896818  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  42.79 
 
 		 206 aa  166  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 212 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3169  50S ribosomal protein L3  43.32 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000263976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>