108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0713 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0678  fimbrial assembly protein  94.31 
 
 		 544 aa  823    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0712  Fimbrial assembly family protein  98.9 
 
 		 545 aa  1026    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0713  Fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 545 aa  1038    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0722  fimbrial assembly family protein  68.15 
 
 		 528 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.48701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2616  cell division protein FtsA  28.45 
 
 		 589 aa  136  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  28.4 
 
 		 359 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  28.09 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  28.09 
 
 		 359 aa  98.2  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  28.09 
 
 		 359 aa  98.2  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  27.55 
 
 		 359 aa  97.4  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  26.85 
 
 		 359 aa  96.3  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  27.24 
 
 		 359 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  27.24 
 
 		 359 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  27.24 
 
 		 359 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  27.45 
 
 		 359 aa  93.6  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  26.07 
 
 		 359 aa  93.2  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  26.2 
 
 		 359 aa  91.3  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  27.24 
 
 		 359 aa  90.1  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  27.24 
 
 		 359 aa  88.2  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  25.93 
 
 		 359 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1037  fimbrial assembly family protein  24.31 
 
 		 486 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.13729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  25.94 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  24.05 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  21.82 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  24.02 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  22.65 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  23.87 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  26.69 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  23.87 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  26.18 
 
 		 354 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  28.3 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  29.66 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  24.12 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  26.3 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  21.35 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  24.23 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  24.93 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  25.89 
 
 		 352 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  28.16 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  26.97 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  21.73 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  27.24 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  25.27 
 
 		 354 aa  70.1  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  25.27 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  26.65 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  27.88 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  28.49 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  26.2 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  26.36 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.8 
 
 		 359 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  27.99 
 
 		 354 aa  66.6  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  27.22 
 
 		 356 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  26.52 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  20.72 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  26.33 
 
 		 594 aa  65.1  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0628418 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  24.38 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  26.76 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  26.49 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  27.91 
 
 		 360 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0671  type IV pilus assembly protein PilM  24.58 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  26.5 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  24.83 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0076  type IV pilus assembly protein PilM  23.48 
 
 		 749 aa  62.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  25.56 
 
 		 359 aa  62  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  27.55 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  21.67 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.19 
 
 		 351 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  27.07 
 
 		 300 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  27.12 
 
 		 358 aa  59.7  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  21.33 
 
 		 352 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  26.77 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  27.5 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  28.1 
 
 		 354 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  27.24 
 
 		 352 aa  56.6  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  28.95 
 
 		 354 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  26.96 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  25 
 
 		 358 aa  55.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  25.43 
 
 		 354 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  27.79 
 
 		 354 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  24.28 
 
 		 359 aa  55.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  23.74 
 
 		 352 aa  53.9  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  21.55 
 
 		 354 aa  53.5  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02355  fimbrial assembly membrane protein  27.04 
 
 		 318 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813602  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  25.34 
 
 		 334 aa  51.2  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  21.07 
 
 		 348 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  23.18 
 
 		 352 aa  50.8  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  25.21 
 
 		 351 aa  50.4  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  28.78 
 
 		 354 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  28.78 
 
 		 362 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  24.78 
 
 		 325 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  26.64 
 
 		 354 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5133  type IV pili biogenesis protein PilM  26.59 
 
 		 293 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  17.93 
 
 		 351 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  24.86 
 
 		 355 aa  47.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  22.42 
 
 		 350 aa  47.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  25.85 
 
 		 379 aa  47.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  23.62 
 
 		 348 aa  47.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  22.56 
 
 		 351 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  24.24 
 
 		 392 aa  47  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  24.59 
 
 		 365 aa  47  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>