136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2616 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2616  cell division protein FtsA  100 
 
 		 589 aa  1165    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0712  Fimbrial assembly family protein  30.7 
 
 		 545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0722  fimbrial assembly family protein  27.53 
 
 		 528 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.48701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0713  Fimbrial assembly family protein  31.27 
 
 		 545 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0678  fimbrial assembly protein  30.06 
 
 		 544 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  30.3 
 
 		 594 aa  75.1  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0628418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  26.2 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  25.27 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  32.17 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  28.46 
 
 		 319 aa  67  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1339  type IV pilus assembly protein PilM  25.46 
 
 		 353 aa  66.6  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  27.84 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  31.25 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  22.01 
 
 		 359 aa  63.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  24.16 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  30.68 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  27.78 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  21.87 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0656  type IV pilus assembly protein PilM  28.26 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000003661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  30.11 
 
 		 352 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  21.51 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  27.49 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  25.87 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  31.3 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  29.23 
 
 		 359 aa  57  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  27.49 
 
 		 359 aa  57  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  29.23 
 
 		 359 aa  57  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  32.06 
 
 		 354 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2686  type IV pilus assembly protein PilM  26.12 
 
 		 367 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000584895  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  26.87 
 
 		 359 aa  55.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1412  cell division protein FtsA  27.62 
 
 		 414 aa  56.2  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.205816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  28.15 
 
 		 350 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  29.01 
 
 		 355 aa  54.3  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  26.82 
 
 		 351 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  25.74 
 
 		 351 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  23.06 
 
 		 352 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  24.48 
 
 		 354 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  24.48 
 
 		 354 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  25.68 
 
 		 354 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  20.7 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0076  type IV pilus assembly protein PilM  25.45 
 
 		 749 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  27.27 
 
 		 351 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  28.46 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  28.46 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  25.52 
 
 		 350 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  20.7 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  20.7 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  20.7 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  30.08 
 
 		 355 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  28.12 
 
 		 352 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  20.7 
 
 		 359 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  27.21 
 
 		 351 aa  51.6  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  26.72 
 
 		 354 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  28.36 
 
 		 350 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  26.14 
 
 		 351 aa  51.2  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0184  type IV pilus assembly protein PilM  24.26 
 
 		 367 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000394027  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  27.69 
 
 		 359 aa  50.8  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2884  cell division protein  31.4 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0459922  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  25.93 
 
 		 360 aa  50.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  29.79 
 
 		 350 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0665  cell division protein FtsA  26.78 
 
 		 411 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000156077  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  29.6 
 
 		 361 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  25.52 
 
 		 359 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0998  type IV pilus assembly protein PilM  31.58 
 
 		 361 aa  49.3  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  28.46 
 
 		 359 aa  48.9  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  25.34 
 
 		 378 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  26.56 
 
 		 358 aa  48.5  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  25.91 
 
 		 379 aa  48.9  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  19.48 
 
 		 347 aa  48.9  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  26.54 
 
 		 350 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09120  cell division protein FtsA  27.33 
 
 		 421 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000811489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  25.44 
 
 		 354 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  26.01 
 
 		 352 aa  48.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  30 
 
 		 358 aa  48.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  25.76 
 
 		 355 aa  48.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2004  cell division protein FtsA  28 
 
 		 408 aa  48.1  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00897575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  26.01 
 
 		 352 aa  47.8  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  26.95 
 
 		 352 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  25.47 
 
 		 350 aa  48.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  26.36 
 
 		 353 aa  47.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  26.59 
 
 		 362 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  29.85 
 
 		 348 aa  47.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3777  cell division protein FtsA  26.67 
 
 		 410 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3917  cell division protein FtsA  26.67 
 
 		 410 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1494  cell division protein FtsA  23.68 
 
 		 664 aa  47.4  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3833  cell division protein FtsA  26.67 
 
 		 410 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  26.67 
 
 		 362 aa  47  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3284  cell division protein FtsA  25.68 
 
 		 412 aa  47  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000382408  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  18.85 
 
 		 351 aa  47  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  25.55 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1244  cell division protein FtsA  24.1 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000360396  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1269  cell division protein FtsA  24.1 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000461742  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0750  cell division protein FtsA  24.62 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000164822  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  23.66 
 
 		 354 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  23.66 
 
 		 354 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1138  cell division protein FtsA  30.32 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  27.78 
 
 		 356 aa  46.2  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  23.81 
 
 		 354 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0528  cell division protein FtsA  25.97 
 
 		 432 aa  46.2  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000421521  hitchhiker  0.000000039224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  23.81 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>