More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2884 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2587  cell division protein FtsA  80.59 
 
 
443 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2075  cell division protein FtsA  81 
 
 
442 aa  739    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2884  cell division protein  100 
 
 
441 aa  877    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0459922  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2846  cell division protein FtsA  80.59 
 
 
443 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67917  hitchhiker  0.00813822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1749  cell division protein FtsA  64.32 
 
 
440 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1426  cell division protein FtsA  64.08 
 
 
440 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.365599  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1383  cell division protein FtsA  64.08 
 
 
440 aa  548  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2002  cell division protein FtsA  64.08 
 
 
437 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0360528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6698  cell division protein FtsA  54.86 
 
 
441 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535042  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3132  cell division protein FtsA  55.2 
 
 
440 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48829  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3175  cell division protein FtsA  54.73 
 
 
440 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0332764  normal  0.87705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0697  cell division protein FtsA  54.17 
 
 
438 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505091  normal  0.501331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7437  cell division protein FtsA  54.17 
 
 
441 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.05738  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2351  cell division protein FtsA  53.2 
 
 
440 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2948  cell division protein FtsA  54.52 
 
 
419 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576909  normal  0.0698479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3494  cell division protein FtsA  52.31 
 
 
438 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.815355 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0942  cell division protein FtsA  52.47 
 
 
432 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000255015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0327  cell division protein FtsA  49.42 
 
 
441 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740051  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2426  cell division protein FtsA  46.73 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116428  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1057  cell division protein FtsA  45.91 
 
 
440 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1285  cell division protein FtsA  45 
 
 
440 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6167  cell division protein ATPase  44.77 
 
 
439 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3299  cell division protein FtsA  43.85 
 
 
440 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2003  cell division protein FtsA  44.21 
 
 
441 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.302134  normal  0.480609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4041  cell division protein FtsA  43.89 
 
 
440 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3387  cell division protein FtsA  43.52 
 
 
427 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2072  cell division protein FtsA  44.68 
 
 
443 aa  350  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.327697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0945  cell division protein FtsA  41.27 
 
 
440 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000880063  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0068  cell division protein FtsA  44.84 
 
 
437 aa  316  7e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3658  cell division protein FtsA  42.45 
 
 
441 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0688  cell division protein FtsA  37.44 
 
 
450 aa  285  9e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0260143  decreased coverage  0.000277221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3165  cell division protein FtsA  41.34 
 
 
464 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2751  cell division protein FtsA  38 
 
 
444 aa  262  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.411174  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0699  cell division protein FtsA  37.65 
 
 
444 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181959  normal  0.281367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2113  cell division protein FtsA  37.41 
 
 
444 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0789  cell division protein FtsA  37.41 
 
 
444 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150702  normal  0.197586 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4488  cell division protein FtsA  39.75 
 
 
444 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00787322  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2417  cell division protein  35.7 
 
 
445 aa  257  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000659549  normal  0.582955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3941  cell division protein FtsA  36.48 
 
 
419 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0748  cell division protein FtsA  35.6 
 
 
412 aa  249  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107961  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1876  cell division protein FtsA  35.77 
 
 
418 aa  246  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1090  cell division protein FtsA  37.89 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0166  cell division protein FtsA  32.94 
 
 
412 aa  243  5e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0606  cell division protein FtsA  36.06 
 
 
411 aa  243  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.943795  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0380  cell division protein FtsA  35.17 
 
 
422 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00706299  normal  0.0389324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0201  cell division protein FtsA  35.17 
 
 
422 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0416  cell division protein FtsA  34.19 
 
 
411 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.840628  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0926  cell division protein FtsA  33.65 
 
 
415 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.998938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3969  cell division protein FtsA  33.87 
 
 
411 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000373054  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2186  cell division protein FtsA  36.53 
 
 
423 aa  239  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0110179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5215  cell division protein FtsA  35.92 
 
 
411 aa  239  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1967  cell division protein  33.02 
 
 
413 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000443484  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2424  cell division protein FtsA  33.89 
 
 
411 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0673361  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0852  cell division protein FtsA  34.45 
 
 
409 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000127132  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0229  cell division protein FtsA  33.02 
 
 
410 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.72026e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04363  cell division protein FtsA  34.86 
 
 
411 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3064  cell division protein FtsA  33.18 
 
 
411 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57290  cell division protein FtsA  35.62 
 
 
417 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4980  cell division protein FtsA  35.62 
 
 
417 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4098  cell division protein FtsA  33.57 
 
 
418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14475  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4669  cell division protein FtsA  33.73 
 
 
419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165844  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4404  cell division protein FtsA  33.33 
 
 
418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0640092  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0948  cell division protein FtsA  34.13 
 
 
418 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249697  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4508  cell division protein FtsA  33.73 
 
 
420 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00626998  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0876  cell division protein FtsA  35.32 
 
 
411 aa  232  9e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1341  cell division protein FtsA  35.88 
 
 
443 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.722513  normal  0.0156243 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0467  cell division protein FtsA  32.63 
 
 
410 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3237  cell division protein FtsA  32.63 
 
 
410 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4383  cell division protein FtsA  35.88 
 
 
420 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000385058  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2547  cell division protein FtsA  32.63 
 
 
410 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3540  cell division protein FtsA  32.63 
 
 
410 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0496  cell division protein FtsA  33.59 
 
 
411 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00048929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1122  cell division protein FtsA  32.63 
 
 
410 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1326  cell division protein FtsA  32.63 
 
 
410 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3546  cell division protein FtsA  32.63 
 
 
410 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3521  cell division protein FtsA  32.63 
 
 
410 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3466  cell division protein FtsA  32.63 
 
 
410 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000117297  hitchhiker  0.00107909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0534  cell division protein FtsA  32.4 
 
 
410 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000483364  normal  0.575152 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0492  cell division protein FtsA  32.4 
 
 
410 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000474873  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3649  cell division protein FtsA  32.4 
 
 
410 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00282858  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0081  cell division protein FtsA  32.4 
 
 
410 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000240923  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0467  cell division protein FtsA  32.4 
 
 
410 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0035462  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0563  cell division protein FtsA  32.4 
 
 
410 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000205481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0513  cell division protein FtsA  33.59 
 
 
411 aa  230  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2669  cell division protein FtsA  32.63 
 
 
410 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00924647  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2188  cell division protein FtsA  35.58 
 
 
412 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.083381  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2086  cell division protein FtsA  34.86 
 
 
412 aa  230  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0360839  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2783  cell division protein FtsA  33.57 
 
 
407 aa  229  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000760847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2832  cell division protein FtsA  32.17 
 
 
410 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000848153  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3777  cell division protein FtsA  32.29 
 
 
410 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0490  cell division protein FtsA  32.4 
 
 
410 aa  229  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00369012  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3917  cell division protein FtsA  33.77 
 
 
410 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3833  cell division protein FtsA  33.77 
 
 
410 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1965  cell division protein FtsA  36.41 
 
 
411 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00000960191  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2044  cell division protein  36.41 
 
 
411 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655425  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2264  cell division protein FtsA  33.01 
 
 
412 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0392802  hitchhiker  0.00222131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13290  cell division protein FtsA  33.33 
 
 
415 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00675344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2448  cell division protein FtsA  32.77 
 
 
411 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00757496  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1117  cell division protein FtsA  34.2 
 
 
411 aa  226  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000192043  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2603  cell division protein FtsA  32.3 
 
 
409 aa  226  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0898076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>