38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1037 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1037  fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 486 aa  989    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.13729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0675  general secretion pathway protein L  24.88 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0713  Fimbrial assembly family protein  28.04 
 
 		 545 aa  60.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0712  Fimbrial assembly family protein  28.04 
 
 		 545 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  25.12 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0678  fimbrial assembly protein  28.99 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  25.95 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0722  fimbrial assembly family protein  27.98 
 
 		 528 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.48701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  26.27 
 
 		 351 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  25.32 
 
 		 350 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  32.63 
 
 		 300 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  26.06 
 
 		 353 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  22.86 
 
 		 351 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  19.64 
 
 		 352 aa  50.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  26.09 
 
 		 350 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  21.43 
 
 		 351 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1836  hypothetical protein  25.32 
 
 		 379 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  23.83 
 
 		 359 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1839  hypothetical protein  25.77 
 
 		 379 aa  47.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  22.75 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  22.75 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  23.66 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  22.75 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  27.04 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  23.83 
 
 		 359 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  22.27 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  22.49 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  28 
 
 		 354 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  22.9 
 
 		 350 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0758  general secretion pathway protein L  23.65 
 
 		 373 aa  44.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0966219  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  27.75 
 
 		 356 aa  44.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  24.17 
 
 		 359 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  28.21 
 
 		 361 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  21.33 
 
 		 359 aa  44.3  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  22.73 
 
 		 403 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  23.36 
 
 		 359 aa  43.9  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  23.83 
 
 		 359 aa  43.5  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  23.57 
 
 		 352 aa  43.5  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>