32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1839 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1839  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  780    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1836  hypothetical protein  97.89 
 
 
379 aa  768    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  23.56 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  22.48 
 
 
369 aa  65.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  21.05 
 
 
397 aa  63.5  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  23.23 
 
 
400 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  22.66 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  21.76 
 
 
425 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  22.9 
 
 
399 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  20.21 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  21.6 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  20.16 
 
 
395 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  20.95 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  20.16 
 
 
395 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  21.09 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  21.09 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  20.83 
 
 
392 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  21.09 
 
 
395 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  20.82 
 
 
403 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  21.47 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  23.62 
 
 
410 aa  47.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  21.61 
 
 
396 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  20.25 
 
 
382 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  19.94 
 
 
382 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  19.81 
 
 
392 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  21.61 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  34.29 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1037  fimbrial assembly family protein  25 
 
 
486 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.13729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  20.84 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  20.82 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  29.13 
 
 
392 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  20.31 
 
 
395 aa  43.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>