69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00609 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  83.95 
 
 		 400 aa  665    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 381 aa  776    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  52.74 
 
 		 403 aa  408  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  43.89 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  32.11 
 
 		 398 aa  210  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  31.13 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  30.87 
 
 		 395 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  28.72 
 
 		 397 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  30.08 
 
 		 395 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  30.08 
 
 		 395 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  30.08 
 
 		 395 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  30.18 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  30.18 
 
 		 395 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  29.92 
 
 		 395 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  30.18 
 
 		 396 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  28.61 
 
 		 401 aa  189  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  28.95 
 
 		 396 aa  189  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  30.21 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  31.63 
 
 		 403 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  28.83 
 
 		 400 aa  186  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  29.66 
 
 		 399 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  29.06 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  30.4 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  30.26 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  26.5 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  24.22 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  26.5 
 
 		 425 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  25.93 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  25.97 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  24.93 
 
 		 392 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  24.63 
 
 		 392 aa  110  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  24.63 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  24.63 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  22.88 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  23.47 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  26.82 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  21.7 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0380  general secretion pathway protein L  22.27 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  0.594502 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0380  general secretion pathway protein L  22.27 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03135  hypothetical protein  22.27 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3527  general secretion pathway protein L  22.27 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03184  general secretory pathway component, cryptic  22.27 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  20.75 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  21.61 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4243  general secretion pathway L  22.39 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.07387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  23.99 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1836  hypothetical protein  21.75 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  24.16 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02779  hypothetical protein  28.24 
 
 		 90 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000163075  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1839  hypothetical protein  20.95 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  28.57 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  23.15 
 
 		 379 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  29.13 
 
 		 466 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  23.12 
 
 		 424 aa  49.7  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  27.87 
 
 		 476 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  32.35 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  32.35 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  27.13 
 
 		 476 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  28.12 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  27.87 
 
 		 478 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  29.73 
 
 		 456 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  29.73 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  33.33 
 
 		 453 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  35.44 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  28 
 
 		 475 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  25 
 
 		 459 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0675  general secretion pathway protein L  21.71 
 
 		 445 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2537  general secretion pathway protein L  22.5 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112302  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  27.17 
 
 		 475 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>