57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_24080 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  95.03 
 
 		 382 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 382 aa  747    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  56.35 
 
 		 379 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  29.22 
 
 		 435 aa  133  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1408  general secretion pathway protein L  34.92 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00703518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  26 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  26.57 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  25.57 
 
 		 425 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  26.27 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  26.07 
 
 		 425 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  25.08 
 
 		 395 aa  90.1  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  26.14 
 
 		 395 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  26.14 
 
 		 395 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  26.14 
 
 		 395 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  25.63 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  25.07 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  22.99 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  25.95 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  25.95 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  27.89 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  23.75 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  29.32 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  27.63 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  26.16 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  25.87 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  26.36 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  26 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  23.26 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  25.36 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  24.86 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  25.62 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  23.04 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  25.62 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  24.57 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  22.35 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  22.89 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1839  hypothetical protein  21.43 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1836  hypothetical protein  21.23 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  27.07 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  23.43 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  23.64 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  20.38 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  23.84 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  28.57 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  24.23 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  40 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  20.28 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  28.4 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  36.56 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  29.06 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  36.25 
 
 		 459 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  27.38 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  37.65 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  37.65 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  27.78 
 
 		 453 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  26.19 
 
 		 457 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  28.21 
 
 		 469 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>