57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0129 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  100 
 
 		 400 aa  823    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  66.58 
 
 		 401 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  63.75 
 
 		 395 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  63.25 
 
 		 395 aa  537  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  62.34 
 
 		 399 aa  529  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  61.5 
 
 		 395 aa  529  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  61.5 
 
 		 395 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  61.75 
 
 		 395 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  62.5 
 
 		 396 aa  522  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  62.84 
 
 		 399 aa  519  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  61.25 
 
 		 395 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  61 
 
 		 395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  59.5 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  61.1 
 
 		 396 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  60.85 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  58.25 
 
 		 398 aa  501  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  36.25 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  33.33 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  33.97 
 
 		 450 aa  212  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  28.88 
 
 		 411 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  31.02 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  29.6 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  28.83 
 
 		 381 aa  186  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  29.17 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  26.43 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  26.34 
 
 		 425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  27.68 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  25.85 
 
 		 425 aa  149  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  23.85 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  24.02 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  23.36 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  23.88 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  23.62 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  27.03 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  22.25 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  25.87 
 
 		 435 aa  99.4  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  22.22 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  24.68 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  24.05 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0380  general secretion pathway protein L  22.17 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3527  general secretion pathway protein L  22.17 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03135  hypothetical protein  22.17 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03184  general secretory pathway component, cryptic  22.17 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0380  general secretion pathway protein L  21.91 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4243  general secretion pathway L  21.85 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.07387 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  23.2 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  22.14 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  32.69 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  31.75 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0149  Type II secretory pathway component PulL-like protein  22.98 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  22.44 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0389  general secretion pathway L  28.17 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.454509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  21.1 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  21.29 
 
 		 379 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1836  hypothetical protein  21.88 
 
 		 379 aa  46.6  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1839  hypothetical protein  20.82 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  35.29 
 
 		 382 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>