49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1893 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  100 
 
 
404 aa  808    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  25.13 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  23.14 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  31.43 
 
 
475 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  24.41 
 
 
399 aa  60.5  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  27.14 
 
 
457 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  28.83 
 
 
469 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  28.83 
 
 
469 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  28.83 
 
 
469 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  27.14 
 
 
468 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  28.83 
 
 
469 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  30.95 
 
 
475 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  28.83 
 
 
462 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  28.83 
 
 
462 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  28.83 
 
 
469 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  27.14 
 
 
457 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  27.14 
 
 
457 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  21.51 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  30.06 
 
 
456 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  26.43 
 
 
456 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  26.43 
 
 
456 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  23.61 
 
 
395 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  26.43 
 
 
453 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  21.98 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  23.25 
 
 
425 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  29.85 
 
 
478 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  31.69 
 
 
476 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  22.25 
 
 
399 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  25.49 
 
 
397 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  23.16 
 
 
395 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  30.23 
 
 
476 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  27.74 
 
 
424 aa  50.4  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  26.17 
 
 
396 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  22.22 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  22.22 
 
 
395 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  23.58 
 
 
425 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  22.22 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  26.17 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  21.14 
 
 
395 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  21.1 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  25.56 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  27.56 
 
 
459 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  22.49 
 
 
400 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  28.87 
 
 
466 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  28.15 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  21.96 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  24.05 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  24.41 
 
 
428 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  21.49 
 
 
411 aa  43.5  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>