63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2037 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 382 aa  749    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  95.03 
 
 		 382 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  54.5 
 
 		 379 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  26.74 
 
 		 435 aa  127  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1408  general secretion pathway protein L  33.51 
 
 		 359 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00703518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  25.58 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  26.16 
 
 		 400 aa  99.8  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  26.54 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  25.92 
 
 		 425 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  24.74 
 
 		 398 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  24.46 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  24.85 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  24.85 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  24.85 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  24.64 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  25.07 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  29.59 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  25.15 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  25.07 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  27.2 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  23.86 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  25.86 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  23.34 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  21.97 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  23.99 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  25.21 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  25.86 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  25.57 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  26.98 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  25.57 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  25.3 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  25 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1836  hypothetical protein  21.74 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  27.95 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  22.13 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1839  hypothetical protein  21.74 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  25.38 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  21.43 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  22.69 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  24.18 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  24.49 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  27.98 
 
 		 280 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  22.7 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  24.72 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  20.92 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  23.14 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  40 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  40.21 
 
 		 456 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  40.21 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  45.9 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  45.76 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  45.76 
 
 		 453 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  45.76 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  45.76 
 
 		 457 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  46.15 
 
 		 469 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  46.15 
 
 		 469 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  46.15 
 
 		 462 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  46.15 
 
 		 469 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  46.15 
 
 		 462 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  46.15 
 
 		 469 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  46.15 
 
 		 469 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  35 
 
 		 459 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  32.69 
 
 		 476 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>