35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0229 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  99.78 
 
 		 462 aa  901    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  99.57 
 
 		 469 aa  899    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  99.78 
 
 		 469 aa  901    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  99.57 
 
 		 469 aa  898    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  99.57 
 
 		 469 aa  899    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  99.57 
 
 		 469 aa  899    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  88.17 
 
 		 456 aa  751    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 462 aa  903    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  69.85 
 
 		 456 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  69.05 
 
 		 468 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  69.91 
 
 		 457 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  69.91 
 
 		 457 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  69.63 
 
 		 456 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  68.4 
 
 		 453 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  69.7 
 
 		 457 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  60.17 
 
 		 475 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  60.39 
 
 		 475 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  56.71 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  35.82 
 
 		 466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3389  general secretion pathway L  32.03 
 
 		 509 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  41.48 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  39.86 
 
 		 476 aa  96.7  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  41.48 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  28.83 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  30.41 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  31.67 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  27.29 
 
 		 416 aa  57  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  36.21 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  31.5 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1326  hypothetical protein  34.26 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  30.7 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  34.38 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  25.49 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4827  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  32.11 
 
 		 410 aa  43.5  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>