37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3226 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  100 
 
 
466 aa  911    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3389  general secretion pathway L  59.6 
 
 
509 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  46.59 
 
 
478 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  46.53 
 
 
476 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  46.15 
 
 
476 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  33.77 
 
 
475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  34.46 
 
 
475 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  34.72 
 
 
456 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  35.63 
 
 
456 aa  170  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  35.24 
 
 
459 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  34.77 
 
 
469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  34.77 
 
 
469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  34.77 
 
 
469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  34.77 
 
 
469 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  34.95 
 
 
462 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  46.27 
 
 
468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  44.78 
 
 
457 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  44.78 
 
 
457 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  44.91 
 
 
456 aa  113  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  44.78 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  44.78 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  44.6 
 
 
469 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  44.6 
 
 
462 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  28.3 
 
 
428 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  28.04 
 
 
403 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  35.62 
 
 
430 aa  57.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  33.09 
 
 
416 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  32.04 
 
 
400 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4827  type II secretion system protein  33.82 
 
 
399 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  29.13 
 
 
381 aa  50.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0539  hypothetical protein  27.3 
 
 
419 aa  50.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  24.68 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55470  type II secretion system protein  33.09 
 
 
380 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105351  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0759  hypothetical protein  32.85 
 
 
411 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.777484  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  33.01 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  28.87 
 
 
404 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  31.1 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0170799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>