36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0016 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  88.17 
 
 		 462 aa  733    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  88.17 
 
 		 462 aa  733    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  87.96 
 
 		 469 aa  731    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  87.96 
 
 		 469 aa  730    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  87.96 
 
 		 469 aa  725    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  100 
 
 		 456 aa  893    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  87.96 
 
 		 469 aa  731    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  87.96 
 
 		 469 aa  731    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  70.68 
 
 		 456 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  67.98 
 
 		 468 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  70.46 
 
 		 456 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  70.37 
 
 		 457 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  70.37 
 
 		 457 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  69.96 
 
 		 457 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  68.85 
 
 		 453 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  57.2 
 
 		 475 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  57.94 
 
 		 475 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  56.04 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  35.86 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  36.59 
 
 		 478 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3389  general secretion pathway L  31.68 
 
 		 509 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  42.03 
 
 		 476 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  43.8 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  27.04 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  30.06 
 
 		 404 aa  63.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  30.94 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  30.49 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  27.63 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  35.34 
 
 		 419 aa  54.3  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  30.7 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1326  hypothetical protein  34.26 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  34.38 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  25.19 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4827  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  32.11 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3177  type II secretion system protein  25.35 
 
 		 381 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.633159  normal  0.0234949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>