34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3396 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  100 
 
 		 476 aa  930    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  94.77 
 
 		 478 aa  868    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  76.51 
 
 		 476 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  46.73 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3389  general secretion pathway L  43.66 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  33.76 
 
 		 475 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  32.98 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  33.69 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  35.62 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  35.62 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  35.48 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  35.25 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  33.63 
 
 		 456 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  31.87 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  32.24 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  31.87 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  31.87 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  31.87 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  32.24 
 
 		 462 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  42.11 
 
 		 468 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  42.41 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  41.61 
 
 		 453 aa  101  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  37.06 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  32.75 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  28.19 
 
 		 428 aa  53.5  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  29.85 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  27.82 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  26.15 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  25.29 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  33.02 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  32.43 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0539  hypothetical protein  25 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  28.45 
 
 		 416 aa  43.9  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0759  hypothetical protein  30.37 
 
 		 411 aa  43.1  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.777484  normal  0.154643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>