35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A3509 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  99.78 
 
 
462 aa  902    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  100 
 
 
469 aa  915    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  99.79 
 
 
469 aa  914    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  99.57 
 
 
469 aa  911    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  100 
 
 
469 aa  915    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  100 
 
 
469 aa  915    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  87.96 
 
 
456 aa  748    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  99.57 
 
 
462 aa  899    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  70.3 
 
 
456 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  70.36 
 
 
457 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  70.36 
 
 
457 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  69.51 
 
 
468 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  70.09 
 
 
456 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  68.87 
 
 
453 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  70.15 
 
 
457 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  60.55 
 
 
475 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  60.77 
 
 
475 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  57.14 
 
 
459 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  35.64 
 
 
466 aa  186  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3389  general secretion pathway L  31.91 
 
 
509 aa  154  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  41.48 
 
 
478 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  39.86 
 
 
476 aa  96.7  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  41.48 
 
 
476 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  28.83 
 
 
404 aa  60.1  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  30.41 
 
 
430 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  31.67 
 
 
428 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  27.29 
 
 
416 aa  57  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  36.21 
 
 
419 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  31.5 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1326  hypothetical protein  34.26 
 
 
407 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  30.7 
 
 
403 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  34.38 
 
 
403 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  25.49 
 
 
400 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4827  type II secretion system protein  27.89 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  32.11 
 
 
410 aa  43.5  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>