38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3945 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 475 aa  936    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  89.89 
 
 		 475 aa  837    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  68.21 
 
 		 459 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  60.63 
 
 		 457 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  59.37 
 
 		 468 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  60.63 
 
 		 457 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  59.54 
 
 		 456 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  58.87 
 
 		 456 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  59.7 
 
 		 457 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  57.72 
 
 		 453 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  60.34 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  60.47 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  60.34 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  60.34 
 
 		 469 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  60.34 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  59.96 
 
 		 462 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  59.96 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  58.53 
 
 		 456 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  34.54 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  33.9 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3389  general secretion pathway L  30.84 
 
 		 509 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  43.94 
 
 		 476 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  44.53 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  28.11 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  31.69 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  37.25 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  32.17 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  30.67 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  34.33 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1326  hypothetical protein  35.14 
 
 		 407 aa  53.5  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  37.93 
 
 		 403 aa  50.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  30.89 
 
 		 416 aa  49.3  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1273  general secretion pathway protein L, putative  26.36 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  27.84 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0670  general secretion pathway L  32.47 
 
 		 409 aa  48.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.216187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0649  General secretion pathway L  32.24 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.01067  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0539  hypothetical protein  28.95 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  28 
 
 		 381 aa  43.5  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>