33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3526 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  100 
 
 		 416 aa  803    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  60.24 
 
 		 416 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0649  General secretion pathway L  62.74 
 
 		 409 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.01067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0670  general secretion pathway L  62.98 
 
 		 409 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.216187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1326  hypothetical protein  49.88 
 
 		 407 aa  315  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  45.18 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0539  hypothetical protein  44.69 
 
 		 419 aa  289  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  48.36 
 
 		 403 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0759  hypothetical protein  45 
 
 		 411 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.777484  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  36.61 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  36.98 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  34 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  27.02 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  32.67 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  36.67 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  36.42 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  36.42 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  33.77 
 
 		 459 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  34 
 
 		 468 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  36 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  32.67 
 
 		 456 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  34.67 
 
 		 456 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  36.17 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  36.17 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  36.17 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  36.17 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  36.17 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  36.17 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  36.17 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  26.15 
 
 		 466 aa  50.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  24.15 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  34.45 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  31.33 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>