59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4350 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 399 aa  810    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  80.95 
 
 		 399 aa  680    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  70.53 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  69.52 
 
 		 396 aa  587  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  65.99 
 
 		 395 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  65.99 
 
 		 395 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  65.74 
 
 		 395 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  65.99 
 
 		 395 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  65.74 
 
 		 395 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  65.74 
 
 		 395 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  65.24 
 
 		 395 aa  553  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  64.68 
 
 		 401 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  62.84 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  65.08 
 
 		 396 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  62.91 
 
 		 398 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  65.08 
 
 		 396 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  40.75 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  33.92 
 
 		 397 aa  249  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  31.55 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  33.57 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  35.07 
 
 		 450 aa  223  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  31.41 
 
 		 400 aa  212  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  30.5 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  29.66 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  29.68 
 
 		 403 aa  189  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  29.21 
 
 		 425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  30.48 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  29.34 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  29.34 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  24.38 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  25.77 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  26.06 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  25.34 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  25.49 
 
 		 392 aa  123  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  24.23 
 
 		 396 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  28.24 
 
 		 412 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  25.54 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  26.07 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  27.11 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  26.04 
 
 		 280 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4243  general secretion pathway L  25.39 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.07387 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0380  general secretion pathway protein L  21.45 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  28.77 
 
 		 410 aa  79.3  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0380  general secretion pathway protein L  21.2 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  0.594502 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03184  general secretory pathway component, cryptic  21.2 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03135  hypothetical protein  21.2 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3527  general secretion pathway protein L  21.2 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  24.51 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  27.89 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  25.34 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  25.93 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  22.25 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  25.71 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0149  Type II secretory pathway component PulL-like protein  25.06 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0389  general secretion pathway L  25.92 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.454509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1326  hypothetical protein  30.54 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  28.19 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0759  hypothetical protein  26.13 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.777484  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  28.78 
 
 		 416 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>