66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1420 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 425 aa  872    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  93.88 
 
 		 425 aa  818    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  52.01 
 
 		 400 aa  428  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  51.88 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  43.75 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  27.3 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  26.16 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  28.26 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  26.32 
 
 		 403 aa  166  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  28.54 
 
 		 399 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  26.96 
 
 		 398 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  28.08 
 
 		 395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  27.72 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  27.32 
 
 		 395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  27.09 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  27.09 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  27.09 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  28.47 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  27.3 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  28.71 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  26.37 
 
 		 401 aa  155  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  25.85 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  27.7 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  26.5 
 
 		 381 aa  146  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  28.4 
 
 		 396 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  28.15 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  26.47 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  26.07 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  24.04 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  29.89 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  21.36 
 
 		 389 aa  97.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  26.71 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  20.6 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  22.61 
 
 		 392 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  22.38 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  22.57 
 
 		 392 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  22.38 
 
 		 392 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  26.72 
 
 		 424 aa  87  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  27.01 
 
 		 435 aa  86.7  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  30.34 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  25.85 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  26.54 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4243  general secretion pathway L  22.6 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.07387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  17.82 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3527  general secretion pathway protein L  25.4 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  27.56 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0675  general secretion pathway protein L  19.84 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0380  general secretion pathway protein L  24.37 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  0.594502 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0380  general secretion pathway protein L  19.95 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03184  general secretory pathway component, cryptic  24.37 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03135  hypothetical protein  24.37 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0389  general secretion pathway L  22.52 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.454509 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  22.3 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1839  hypothetical protein  21.76 
 
 		 379 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  21.57 
 
 		 280 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  23.25 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1836  hypothetical protein  20.67 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1273  general secretion pathway protein L, putative  24.39 
 
 		 437 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  26.53 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3372  general secretion pathway protein L, putative  23.74 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.438092 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  33.78 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  33.08 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  26.46 
 
 		 457 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  26.46 
 
 		 457 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0600  general secretion pathway protein L  19.64 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000250804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0587  general secretion pathway protein L  19.64 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>