35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4243 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4243  general secretion pathway L  100 
 
 		 364 aa  742    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.07387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  26.14 
 
 		 397 aa  93.6  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  26.42 
 
 		 395 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  25.08 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  25.08 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  24.77 
 
 		 395 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  24.46 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  24.76 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  24.38 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  25.91 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  25.61 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  25.39 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  24.47 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  23.76 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  26.88 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  25.23 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  21.85 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  24.92 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  25.29 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  23.59 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  22.61 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  22.6 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  23.6 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  22.73 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  24.13 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  23.03 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  24.12 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  22 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  22.39 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  23.25 
 
 		 396 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  33.88 
 
 		 412 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  23.24 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  24.1 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  27.98 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  31.82 
 
 		 410 aa  43.1  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>