57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0157 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  93.94 
 
 		 395 aa  758    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  84.85 
 
 		 395 aa  697    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  99.49 
 
 		 396 aa  804    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  85.1 
 
 		 395 aa  698    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  84.85 
 
 		 395 aa  697    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  94.19 
 
 		 395 aa  759    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  83.84 
 
 		 395 aa  686    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  84.85 
 
 		 395 aa  696    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 396 aa  807    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  67.34 
 
 		 396 aa  554  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  65.33 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  65.74 
 
 		 398 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  65.17 
 
 		 401 aa  535  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  65.08 
 
 		 399 aa  528  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  65.08 
 
 		 399 aa  524  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  60.85 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  36.75 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  31.91 
 
 		 397 aa  217  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  30.9 
 
 		 400 aa  216  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  29.68 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  31.77 
 
 		 403 aa  199  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  33.25 
 
 		 450 aa  200  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  30.18 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  29.7 
 
 		 403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  27.71 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  29.77 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  27.9 
 
 		 425 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  28.4 
 
 		 425 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  26.51 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  21.88 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  22.36 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  31.39 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  23.84 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  23.98 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  23.29 
 
 		 392 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  23.84 
 
 		 392 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  23.56 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  24.54 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  24.19 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  35.03 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4243  general secretion pathway L  25.23 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.07387 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0380  general secretion pathway protein L  24.44 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0380  general secretion pathway protein L  24.44 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3527  general secretion pathway protein L  24.44 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03135  hypothetical protein  24.44 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03184  general secretory pathway component, cryptic  24.44 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  23.98 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  23.43 
 
 		 280 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  25.87 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  37.62 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0389  general secretion pathway L  23.17 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.454509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  24.68 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  23.88 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  26.17 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1836  hypothetical protein  22.66 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1839  hypothetical protein  21.61 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  34.38 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>