53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2388 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 410 aa  787    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  37.04 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  35.14 
 
 		 412 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  31.12 
 
 		 425 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  30.43 
 
 		 425 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  29.48 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  27.97 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  27.57 
 
 		 395 aa  100  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  27.57 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  28.03 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  27.57 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  28.74 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  27.57 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  28.45 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  29.77 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  28.29 
 
 		 395 aa  94  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  29.35 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  27.67 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  24.94 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  28.19 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  27.49 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  28.45 
 
 		 399 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  24.91 
 
 		 401 aa  86.3  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  27.19 
 
 		 396 aa  86.7  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  26.53 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1836  hypothetical protein  22.25 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  25.2 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  25.22 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1839  hypothetical protein  21.97 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  25.54 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  30.22 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  29.23 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  23.67 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  23.26 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  29.32 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  21.85 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  24.71 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  22.9 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  18.87 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  22.98 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  28.17 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  18.5 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  22.16 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  24.13 
 
 		 392 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  23.75 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  27.01 
 
 		 404 aa  50.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  24.42 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  24.13 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  33.33 
 
 		 456 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0149  Type II secretory pathway component PulL-like protein  26.18 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4243  general secretion pathway L  31.82 
 
 		 364 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.07387 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  31.65 
 
 		 457 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  31.65 
 
 		 457 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>