44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1356 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  100 
 
 
435 aa  887    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  27.49 
 
 
412 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  27.88 
 
 
382 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  25.51 
 
 
395 aa  106  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  25.51 
 
 
395 aa  106  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  25.51 
 
 
395 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  25.51 
 
 
395 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  24.15 
 
 
395 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  24.93 
 
 
398 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  27.88 
 
 
379 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  25.87 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  25 
 
 
401 aa  97.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  24.27 
 
 
395 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  26.74 
 
 
382 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  24.64 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  23.86 
 
 
397 aa  93.2  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  23.98 
 
 
396 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  26.01 
 
 
400 aa  90.9  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  24.35 
 
 
396 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  25.5 
 
 
399 aa  88.2  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  25.65 
 
 
399 aa  88.2  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  24.86 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  23.68 
 
 
399 aa  87.4  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  27.01 
 
 
425 aa  87  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  27.17 
 
 
424 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  22.47 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  23.58 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  23.43 
 
 
400 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  21.61 
 
 
450 aa  73.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  25 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  23.73 
 
 
379 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  23.16 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  20.3 
 
 
411 aa  63.9  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  20.75 
 
 
381 aa  63.2  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  22.22 
 
 
411 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  22.28 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  20.96 
 
 
396 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1408  general secretion pathway protein L  28.57 
 
 
359 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00703518  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  24.03 
 
 
403 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  27.59 
 
 
400 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  31.47 
 
 
456 aa  46.6  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  24.39 
 
 
456 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  32.73 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1836  hypothetical protein  19.83 
 
 
379 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>