66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03964 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 399 aa  811    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  52.64 
 
 		 397 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  38.29 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  39.8 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  40 
 
 		 399 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  37.75 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  36.36 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  40.75 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  37.78 
 
 		 395 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  37.78 
 
 		 395 aa  263  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  37.78 
 
 		 395 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  36.25 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  37.03 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  37.74 
 
 		 450 aa  256  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  36.52 
 
 		 395 aa  255  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  36.52 
 
 		 395 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  36.27 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  36.43 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  36.43 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  32.85 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  30.52 
 
 		 403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  31.45 
 
 		 400 aa  187  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  31.11 
 
 		 403 aa  182  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  30.26 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  27.7 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  27 
 
 		 400 aa  145  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  26.96 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  25.63 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  29.06 
 
 		 379 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  25.82 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  23.97 
 
 		 389 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  23.68 
 
 		 435 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  24.86 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  24.86 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  24.86 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  22.31 
 
 		 396 aa  87  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  25.13 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  26.48 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  27.81 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  27.3 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  24.41 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  23.05 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  27.11 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1836  hypothetical protein  20.21 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  24.6 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1839  hypothetical protein  20.21 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  22.35 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  24.86 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1273  general secretion pathway protein L, putative  24.54 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0675  general secretion pathway protein L  22.84 
 
 		 445 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0380  general secretion pathway protein L  19.94 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  26.61 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  26.61 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3527  general secretion pathway protein L  18.73 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  26.19 
 
 		 457 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03184  general secretory pathway component, cryptic  19.62 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2213  General secretion pathway L  29.86 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0380  general secretion pathway protein L  19.62 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03135  hypothetical protein  19.62 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  26.61 
 
 		 457 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  26.61 
 
 		 457 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  23.67 
 
 		 468 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0600  general secretion pathway protein L  23.3 
 
 		 428 aa  46.6  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000250804 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0389  general secretion pathway L  22.72 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.454509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  25.69 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0587  general secretion pathway protein L  22.97 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>