43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3235 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  89.47 
 
 
456 aa  748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  84.62 
 
 
468 aa  733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  92.59 
 
 
457 aa  758    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  100 
 
 
453 aa  888    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  92.37 
 
 
457 aa  770    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  92.37 
 
 
457 aa  770    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  89.25 
 
 
456 aa  758    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  69.94 
 
 
469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  69.94 
 
 
469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  69.94 
 
 
469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  69.94 
 
 
469 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  69.94 
 
 
469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  69.93 
 
 
456 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  69.48 
 
 
462 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  69.48 
 
 
462 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  58.56 
 
 
475 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  58.56 
 
 
475 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  59.44 
 
 
459 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  38 
 
 
466 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3389  general secretion pathway L  33.97 
 
 
509 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  34.13 
 
 
478 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  40.15 
 
 
476 aa  97.8  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  41.61 
 
 
476 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  27.65 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1326  hypothetical protein  29.3 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  32.42 
 
 
428 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  31.25 
 
 
430 aa  64.3  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  27.05 
 
 
416 aa  63.5  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  36.11 
 
 
419 aa  60.1  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  23.41 
 
 
404 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  30.3 
 
 
403 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  33.03 
 
 
381 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  39.02 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4827  type II secretion system protein  27.89 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  31.58 
 
 
400 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3177  type II secretion system protein  26.76 
 
 
381 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.633159  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0670  general secretion pathway L  40 
 
 
409 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.216187 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  39.58 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0649  General secretion pathway L  40 
 
 
409 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.01067  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  35.94 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0759  hypothetical protein  27.91 
 
 
411 aa  44.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.777484  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  38.1 
 
 
382 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  34.23 
 
 
425 aa  43.1  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>