32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5694 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  100 
 
 		 430 aa  835    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  50.35 
 
 		 416 aa  331  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0649  General secretion pathway L  49.41 
 
 		 409 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.01067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0670  general secretion pathway L  49.41 
 
 		 409 aa  282  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.216187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  45.18 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0539  hypothetical protein  42.69 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1326  hypothetical protein  43.16 
 
 		 407 aa  256  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  43.56 
 
 		 403 aa  253  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0759  hypothetical protein  42.33 
 
 		 411 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.777484  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  38.28 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  34.62 
 
 		 419 aa  155  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  32.11 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  32.11 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  31.25 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  32.09 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  25.28 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  37.25 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  33.06 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  33.06 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  33.06 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  33.06 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  33.06 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  33.06 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  33.33 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  33.06 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  35.62 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  35.25 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  33.33 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  30.81 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  28.72 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  32.75 
 
 		 476 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3389  general secretion pathway L  34.31 
 
 		 509 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>