42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0649 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0649  General secretion pathway L  100 
 
 		 409 aa  787    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.01067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0670  general secretion pathway L  99.76 
 
 		 409 aa  785    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.216187 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  67.93 
 
 		 416 aa  481  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  62.98 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  49.88 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1326  hypothetical protein  48.91 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  48.08 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0539  hypothetical protein  46.85 
 
 		 419 aa  296  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0759  hypothetical protein  46.65 
 
 		 411 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.777484  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  35.9 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  39.24 
 
 		 419 aa  186  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  28.43 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  32.24 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  35.04 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  35.04 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  30.92 
 
 		 475 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  25.97 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  32.41 
 
 		 468 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  29.73 
 
 		 457 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  29.73 
 
 		 457 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  29.73 
 
 		 457 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  28.49 
 
 		 453 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  33.61 
 
 		 478 aa  53.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  27.6 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  27.87 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  34.74 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  34.74 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  34.74 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  34.74 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  34.74 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  34.74 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  34.74 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3177  type II secretion system protein  27.4 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.633159  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  34.74 
 
 		 456 aa  46.6  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  28.47 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  28.47 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  28.47 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  33.62 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  26.92 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  34.78 
 
 		 403 aa  43.9  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  32.65 
 
 		 400 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  26.04 
 
 		 398 aa  42.7  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>