37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3133 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 419 aa  811    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  51.52 
 
 		 428 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0539  hypothetical protein  36.28 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  38.46 
 
 		 403 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  37.44 
 
 		 416 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  34.62 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0649  General secretion pathway L  37.86 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.01067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0670  general secretion pathway L  37.86 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.216187 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  36.66 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1326  hypothetical protein  39.52 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0759  hypothetical protein  34.51 
 
 		 411 aa  142  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.777484  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  29.03 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  35.17 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  36.11 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  34.55 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  34.55 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  36.11 
 
 		 453 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  32.17 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  35.42 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  35.42 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  35.42 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  31.47 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3389  general secretion pathway L  35.78 
 
 		 509 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  36.21 
 
 		 462 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  32.08 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  36.21 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  36.21 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  36.21 
 
 		 469 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  36.21 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  36.21 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  36.21 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  28.27 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  35.34 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  31.45 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  28.93 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  33.7 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  34.48 
 
 		 400 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>