35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3424 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  100 
 
 		 428 aa  834    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  51.76 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  38.05 
 
 		 430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  37.05 
 
 		 403 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0539  hypothetical protein  34.78 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1326  hypothetical protein  36.39 
 
 		 407 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  36.4 
 
 		 416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  36.61 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0649  General secretion pathway L  35.38 
 
 		 409 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.01067  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0759  hypothetical protein  30.3 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.777484  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0670  general secretion pathway L  35.14 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.216187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  28.06 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  28.41 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  34.64 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  31.79 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  36.09 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  32.89 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  35.34 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  35.34 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  35.34 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  34.59 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  33.83 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  34.59 
 
 		 456 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  36.29 
 
 		 476 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  24.41 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  26.8 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  35.86 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  31.67 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  31.67 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  31.67 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  31.67 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  31.67 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  31.67 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  31.67 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  31.67 
 
 		 456 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>