19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0539 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0539  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  822    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0759  hypothetical protein  52.57 
 
 		 411 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.777484  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1326  hypothetical protein  49.39 
 
 		 407 aa  323  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  47.75 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  44.5 
 
 		 416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  42.45 
 
 		 430 aa  277  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  43.4 
 
 		 416 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0649  General secretion pathway L  45.57 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.01067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0670  general secretion pathway L  45.57 
 
 		 409 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.216187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  34.78 
 
 		 428 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  36.28 
 
 		 419 aa  169  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  26.72 
 
 		 466 aa  51.2  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  30.95 
 
 		 475 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  25.93 
 
 		 478 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  28.66 
 
 		 475 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  31.17 
 
 		 459 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  22.51 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  34.21 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  30.33 
 
 		 400 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>