26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3389 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3389  general secretion pathway L  100 
 
 		 509 aa  1004    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  60 
 
 		 466 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  44.55 
 
 		 478 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  43.86 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  42.77 
 
 		 476 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  33.69 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  34.18 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  34.18 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  30.86 
 
 		 475 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  32.36 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  33.33 
 
 		 459 aa  157  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  31.85 
 
 		 469 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  31.85 
 
 		 469 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  31.85 
 
 		 469 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  31.85 
 
 		 469 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  31.97 
 
 		 462 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  31.97 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  31.61 
 
 		 456 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  43.21 
 
 		 453 aa  98.6  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  40 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  39.26 
 
 		 468 aa  95.9  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  40.3 
 
 		 457 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  37.86 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  35.78 
 
 		 419 aa  52  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  34.29 
 
 		 430 aa  50.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  28.28 
 
 		 403 aa  47  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>