14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4827 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4827  type II secretion system protein  100 
 
 		 399 aa  760    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55470  type II secretion system protein  85.03 
 
 		 380 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105351  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3177  type II secretion system protein  39.7 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.633159  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2213  General secretion pathway L  28.8 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  33.82 
 
 		 466 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  27.89 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  27.89 
 
 		 457 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  27.89 
 
 		 457 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  27.89 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  27.89 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  29.25 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  27.89 
 
 		 456 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  29.25 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  30.61 
 
 		 478 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>